生物医学中的系统生物学（System Biology in Biomedicine）

周学时：2 学  分：2

授课对象：硕、博

课程简介：

开课目的：系统生物学是当前生命科学、医学、数理科学和计算机科学等多学科交叉的前沿热点领域，主要针对细胞网络的组分以及组分间相互作用、高通量全基因实验技术的应用、以及计算方法与实验结果的整合等三方面内容进行协同研究，揭示以生物大分子层次、细胞层次的生物复杂性，以及生长、发育、遗传、进化等生命现象的根本规律。由于系统生物学的学科交叉特色，长期以来，生物医学领域的研究生缺乏相对完整、系统的系统生物学理论、方法的学习和训练。本课程即面向该相关专业的研究生，提供系统的学习研讨，主要目的是讲述和讨论生物医学领域的系统生物学基础知识，追踪学科前沿的最新进展和动态，学习系统生物学高水平研究工作的选题、研究思想和方法；本课程适用于生物医学工程专业、分子医学等相关专业方向的硕士、博士研究生。

开课基础：授课教师长期从事计算系统生物学、生物信息学领域的研究，已经在微生物基因组学方面发展了一系列的原创性方法，做出了具有特色的研究工作，在《核酸研究（Nucleic Acids Res.）》、《生物信息学（Bioinformatics）》等相关国际权威期刊上发表了相当数量的论文，累计SCI影响因子总和超过50。同时，曾经分别为本科生和研究生开设《生物信息学导论》、《生物医学应用数学》等课程，这些课程与本课程具有很大的关联。因此，授课教师既有系统生物学相关前沿领域的研究成果，也有比较丰富的教学经验。

参考书目：

1. Klipp E.等著、贺福初等译，《系统生物学的理论、方法和应用》，复旦大学出版社，2007

2. Boogerd F. C., Bruggeman F. J.等著、孙之荣译，《系统生物学哲学基础》，科学出版社，2008

3. Alberghina L. et. al., 《System Biology: Definitions and Perspectives》, Springer- Verlag Gmb. H. & Co., 2005

4. Pevsner J.著，孙之荣译，《生物信息学与功能基因组学》，化学工业出版社，2006

5. 以下列发表系统生物学方面论文的国际一流刊物为延伸学习参考资料：《科学（Science）》、《自然（Nature）》、《美国科学院院报（Proceedings of the National Academy of Sciences，USA）》、《基因组研究（Genome Research）》、《核酸研究（Nucleic Acid Research）》、《生物信息学（Bioinformatics）》、《分子系统生物学（Molecular System Biology）》