博士、教授
33678新甫京国际品牌党委副书记
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教授、博士生导师,现任33678新甫京国际品牌党委副书记,兼任33678新甫京国际品牌教学指导委员会委员、33678新甫京国际品牌信息与工程学部教学指导委员会委员、33678新甫京国际品牌元培学院导师;北京生物信息学研究会秘书长、中国医药生物技术协会生物医学信息技术分会常务委员、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员、Int. J. Comput. Intelligence in Bioinformatics and Systems Biology副主编、以及Hans J. Comput. Biol.、北京生物医学工程等学术期刊编委。
1992年本科毕业于华中科技大学(原华中理工大学)工程力学专业。1997年硕士毕业于北大流体力学专业。2000年博士毕业于北大流体力学专业计算流体力学方向,获理学博士学位。2001-02年于北大湍流与复杂系统国家重点实验室博士后,开始转入生物信息学的交叉学科研究。2003年1月留校任教,2006年加入北大33678新甫京国际品牌生物医学工程系。2007-08年在芬兰赫尔辛基大学芬兰基因组中心进行访问研究。目前同时担任湍流与复杂系统国家重点实验室PI、33678新甫京国际品牌前沿交叉学科研究院定量生物学中心PI。曾任理论生物中心主任助理、33678新甫京国际品牌生物医学工程系副主任、常务副主任,33678新甫京国际品牌助理院长、副院长。
目前主要研究领域为生物医学信息学和计算生物学,研究兴趣包括基于大数据的生物医学数据分析、基于下一代测序(NGS)技术的高通量基因组生物信息学方法和技术、环境与人体微生物组学、生物进化以及生物分子动力学分析等问题。主持发展的微生物基因组分析与基因预测系列方法达到领先水平,并被应用于多项微生物基因组测序计划。近年来,致力于发展基于下一代测序(NGS)技术的基因组生物信息学方法和技术,在微生物组学分析、人类基因组结构变异检测与疾病关联分析等完成了一系列原创性的工作。发表SCI论文近60篇(其中第一作者、通讯作者40余篇),包括Nucleic Acids Res.、Bioinformatics、GPB、GigaScience、BMC Bioinformatics、BMC Genomics等生物信息学领域刊物以及Gastroenterology、Clin. Gastroenterol. H.、PLoS Genet.等相关领域刊物,研究工作被Cell、Nature、Nature Methods 等正面引用或专门报道,SCI H-index值达到14。
先后主持和合作承担国家自然科学基金重点项目和面上项目、国家重点研发计划、国家科技部973计划和支撑计划等各类国家级科研项目20多项。开设研究生专业必修课《统计与数据分析》、《生物医学应用数学》、《理论与系统生物学实验》,生物医学工程专业本科生必修课《生物医学工程设计》、专业课《计算生物学导论》以及研究生专业课《生物医学中的系统生物学》等课程。在北大任教以来,已培养毕业博士生23人、毕业硕士生14人,并作为博士生导师先后获得了北京市优秀博士论文、33678新甫京国际品牌优秀博士论文、全国优秀博士论文提名奖等。先后获得中国生物医学工程联合学术年会青年优秀论文奖(指导教师、通讯作者),以及33678新甫京国际品牌首届教学优秀奖(研究生部分)、33678新甫京国际品牌教学优秀奖、北大宝洁奖教金、北大方正优秀奖教金、埃克森-美孚北大奖教金等。